SPAMfighter Mail Gateway har adskillige måder at bestemme, om en e-mail er spam eller ej. Den mest betydningsfulde måde er ved at oprette en unik signatur for hver e-mail og dens elementer og sende denne signatur til SPAMfighter-serveren til evaluering. Bagefter returnerer serveren en score med beslutningen, hvis meddelelsen er spam eller ej. Den originale e-mail forlader aldrig serveren under SPAMfighter Mail Gateway-filtrering.